As atividades do CEPEMHEd são realizadas por uma Diretoria composta por professores da rede pública municipal e estadual de ensino, cedidos, sem cargo comissionado, indicados pelas instituições que compõem o Conselho Deliberativo e aprovados através de votação por estas entidades.
Em 2014, sua equipe é composta por:
Centro de Memória da Educação 